绘制中国人肾透明细胞癌蛋白质基因图谱

时间： 2022-04-27 13:24     

本报讯 中国是肾癌大国，其中40%的肾癌患者在初诊或随访过程中出现转移，从而导致治疗效果不佳。其中，遗传异质性高、缺乏精准有效治疗靶点是肾癌治疗效果差的主要原因。

复旦大学附属肿瘤医院教授叶定伟团队携手复旦表型研究院教授丁琛团队和上海交通大学医学院附属新华医院教授赵健元团队，成功绘制出中国人肾透明细胞癌蛋白质基因图谱，并根据蛋白质组表达谱进行分子分型，为透明肾癌的精准治疗提供新的干预靶点和理论依据。该项成果近日在线发表于《自然—通讯》。

早在2019年，美国临床蛋白质组学肿瘤分析联盟（CPTAC）就公布了103例透明细胞肾癌患者的蛋白质基因组学特征，为欧美国家的肾癌精准治疗提供了依据。但该研究并不能满足国人肾癌临床和基础研究的迫切需求。

为破解这一难题，叶定伟团队和丁琛、赵健元团队合作，对232例中国人群肾透明细胞癌进行蛋白质基因组学测序分析，并结合患者临床病理特征和生存数据进行分析。

研究中，联合团队首次通过大样本队列描绘了中国透明细胞肾癌的蛋白基因图谱。结果发现，突变率最高的基因是VHL（64.3%），其次是PBRM1（24.5%）、BAP1（10.7%）和SETD2（8.9%）。

“中国人群肾癌关键致病基因的突变频率与欧美人群存在显著差异。” 叶定伟说，“VHL和SETD2的突变率在欧洲队列中最高，PBRM1和MTOR的突变率在TCGA队列中最高，PBRM1和SETD2的突变率在本研究队列中最低。”

研究人员根据蛋白组表达谱，将患者分为免疫浸润型（GP1）、代谢改变型（GP2）和间质为主型（GP3）三型，其中GP1亚型免疫浸润型恶性程度最高、侵袭性最强、预后最差，提示需要更加积极的治疗。该研究在肾癌发生分子机制研究中进一步发现，烟酰胺N—甲基转移酶（NNMT）作为一种重要的甲基化催化酶，可以激活DNA损伤修复关键蛋白DNA-PKcs的活性，增强DNA修复，进而促进肾癌细胞增殖。这一发现提示NNMT不仅可作为透明细胞肾癌潜在的生物标记物，还是GP1亚型潜在的药物靶点。（张双虎 黄辛）

相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41467-022-29577-x

关键词 : 基因